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中山市孙中山研究所自2002年成立以来，充分利用孙中山故居纪念馆的业务基础，坚持“立足本地、扬长避短、夯实基础、逐渐推进”的研究工作方针，并加以充实、拓展，逐步建立区域孙中山与近代中国的研究中心和资料中心。四年来工作主要包括以下几方面：
1、在图书资料室基础上组建“逸仙图书馆”，逐步建立孙中山研究文献资料中心。一方面加大投入，积极开展图书采购和文献资料的整理、收集工作；另一方面为孙中山研究著名学者捐赠的书籍建立个人专柜及专藏目录，既丰富了藏书，也作为对著名学者的认同和纪念，并可增加自身文化内涵。四年来，投入资金约110万元，采购了全套《申报》、天津《大公报》、《中央日报》、《广州民国日报》等大型民国报刊复印本以及《近代中国史料丛刊》（全套3000多册）等一批颇有价值的专业图书文献。
2、业务工作现代化。充分利用孙中山故居纪念馆电脑网络系统，并以每年约10至20万元的投入，提升办公网络化、数字化的水平，进而提升业务和管理的现代化水平。在积极建设互联网站点，建立文献、图片数据库的同时，协助孙中山基金会建立并维护其网页。
3、锻炼和培养人才队伍。人才引进和岗位培训相结合，以项目锻炼人，通过参与国家社会科学研究项目、大型学术讨论会、组织策划各种展览等，使员工的科研、业务组织能力，学术水平通过实践得到提高。努力为业务研究人员创造良好的工作条件，使他们心情舒畅安心做好工作。
4、以基地建设促业务发展。在建设好“全国爱国主义教育示范基地”的同时，与相关机构签约建立了“广东省社会科学院孙中山研究基地”、“中山大学中国近现代史教学实践基地”等。我们为签约方提供工作条件，签约方为我们提供人才及人力资源的帮助，由此推动和促进自身业务发展。近年来还与国内外及港、澳、台地区孙中山、宋庆龄纪念机构、相关博物馆、相关研究机构和专家建立了广泛的业务联系与交流合作关系。
这些基础工程的建设初见成效，为孙中山故居纪念馆（孙中山研究所）的研究和业务工作的开展打下了坚实的基础，研究成果累累；近年来承担、参与的项目主要有：国家社科项目《宋庆龄与中国近代化》，国家社科项目《孙中山的系统思维观》；省级项目《广东省志·孙中山志》；中山市项目《孙中山祖籍研究》、国家级历史文化名村申报材料；本馆项目：《孙中山论思想道德修养》、《孙眉年谱》、《李仙根日记·诗集》、《中山碑铭调查与研究（南朗篇）》、翻译《Sun Yat Sen — As I knew him》等。支持协助项目主要有：《孙文全集》和《孙文选集》编纂、澳大利亚社会科学院院士、悉尼大学黄宇和博士课题《孙中山成长历程研究》、我市《香山文化研究》、《翠亨村历史文化保护规划》及我市孙中山与近代社会相关的史迹调查评估、出版物编辑、展览制作等。亦吸引了北京大学、广东省社会科学院、中山大学、澳大利亚悉尼大学、美国耶鲁大学等研究机构的国内外著名学者前来交流、考察和开展研究工作。
据不完全统计，近年本馆（所）主要学术活动和学术成果有：策划组织或承办较大型活动（含国际）会议5次，一般纪念会、座谈会10次；派员出席省级以上学术会议超过25人次；组织策划举办相关展览超过20个；编纂《翠亨历史文化丛书》，组织策划或合作或资助出版相关业务书籍16册（套），四年来发表论文超过36篇。
此前，大型图册《孙中山与宋庆龄》曾荣获中国图书奖、广东省“五个一工程”奖、广东省精神文明产品精品奖、广东省优秀社会科学研究成果奖、广东省宣传文化精品奖；2003年，《孙中山家世---资料与研究》、大型图册《伟大的民主革命先驱—孙中山》、《孙中山的亲属与后裔》分别获中山市优秀精神产品奖、优秀社科成果奖；2004年，参与编纂的《广东省志·孙中山志》获省地方志书一等奖。2007年，《孙眉年谱》、《孙中山与香山南朗程氏》等成果先后获中山市优秀社科成果奖、中山市宣传文化精品奖。